La Fundación San Ignacio fue constituida el 21 de septiembre de 2006 por iniciativa de la Orden Religiosa Compañía de Jesús, aprobando sus estatutos e iniciando los trámites destinados a la obtención de personalidad jurídica. De este acto constitutivo y de sus estatutos existe constancia en escritura pública otorgada en la Notaría de Santiago de don Alberto Mozó Aguilar, bajo el repertorio Nº 5.512-2002.
La Fundación obtuvo su personalidad jurídica con fecha 8 de marzo de 2007, mediante Decreto Exento Nº 793 del Ministerio de Justicia. Su extracto fue publicado en el Diario Oficial el 31 de marzo de 2007, y posteriormente protocolizado el 2 de abril del mismo año en la referida Notaría de Santiago, bajo el repertorio Nº 1.619-2007.
Al momento de su constitución, en septiembre de 2007, y de conformidad con lo dispuesto en el artículo segundo transitorio de sus estatutos, el Consejo Directivo estuvo integrado por cinco miembros.
Actualmente, el Consejo Directivo está integrado por:
- P. Juan Cristóbal García-Huidobro S.J., Delegado del Provincial de Chile para la Educación Escolar y Presidente del Consejo Directivo.
- Señor Cristián O'Ryan, Vicepresidente Ejecutivo para los Colegios Jesuitas con financiamiento compartido.
- Señora Macarena Rubio.
- P. Dagoberto Lagos S.J.
- Señor Gabriel Gutiérrez.
- Señora Carolina Gana.
- Señor Rodrigo Roblero.